Arrivée d’Abdallah Toumji dans l’équipe BCI du laboratoire CRIStAL de Lille,
pour un stage du 6 mai au 12 juillet 2024, sous la direction du Pr. François Cabestaing.
Titre su stage : Application de visualisation et d’édition d’arborescences BIDS .
Dans le domaine des neurosciences expérimentales, l’accès aux données reste un problème complexe. Plusieurs formats de stockage ont co-existé pendant des années, sans faire consensus, ce qui rendait la tâche des chercheurs très difficile lorsqu’ils voulaient rendre leurs logiciels de traitement ou de visualisation interopérables.
Récemment, un format permettant de stocker ces données ainsi que les métadonnées relatives aux expérimentations a été proposé: le BIDS (Brain Imaging Data Structure) [https://bids.neuroimaging.io].
Ce format commence a être largement utilisé et de plus en plus de bibliothèques de traitement des données sont capables d’importer ou d’exporter des données BIDS. Malgré tout, l’utilisation directe des ces bibliothèques reste assez complexe, ou tout au moins réservée aux spécialistes.
Ce format commence a être largement utilisé et de plus en plus de bibliothèques de traitement des données sont capables d’importer ou d’exporter des données BIDS. Malgré tout, l’utilisation directe des ces bibliothèques reste assez complexe, ou tout au moins réservée aux spécialistes.
L’objectif du stage sera de développer une application, simple et évolutive, permettant de visualiser les données BIDS. On envisagera également la possibilité d’apporter des modifications basiques aux données (annotations par exemple) à partir de cette application.
